ОПТИМИЗАЦИЯ СТРАТЕГИИ ГЕНОТИПИРОВАНИЯ ШТАММОВ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS В ОДЕССКОЙ ОБЛАСТИ УКРАИНЫ: СРАВНЕНИЕ МЕТОДОВ СПОЛИГОТИПИРОВАНИЯ И VNTR

Рассматриваются вопросы выбора стратегии генотипирования штаммов M. tuberculosis, циркулирующих в Одесской области Украины, с учетом данных о значительной распространенности штаммов семейства Beijing в данном регионе. Выявлено, что сполиготипирование не может применяться для дифференцировки штаммов внутри группы Beijing вследствие низкой чувствительности (индекс HGDI=0,173). Более высокая разрешающая способность (HGDI=0,723) была продемонстрирована при применении для генотипирования этой группы штаммов метода VNTR с использованием 15 локусов (12 локусов MIRU и 3 локусов ETR).