Одеський національний медичний університет, Одеса, Україна,
Фізико-хімічний інститут імені О. В. Богатського Національної академії наук України, Одеса, Україна
DOI 10.32782/2226-2008-2025-6-15
Мета роботи – на основі розроблених QSAR моделей виявити основні структурні чинники молекул амонієвих гексафторосилікатів (АГФС), що визначають їх антикарієсну активність, зокрема карієс-профілактичну ефективність (КПЕ) і мінералізуючий індекс (МІ). Об’єктом дослідження була вибірка з 22 АГФС. Використовуючи 2D-симплексний підхід, побудовано адекватні QSАR PLS-моделі для КПЕ і МІ досліджуваних солей. Проведено аналіз відносних внесків різних типів дескрипторів у розрахункові величини досліджуваних властивостей. У результаті структурної інтерпретації побудованих QSAR моделей одержано інформацію щодо напряму модифікації структур амонієвих гексафторосилікатів для створення більш ефективних та перспективних антикарієсних агентів. За допомогою молекулярного дизайну сконструйовано нову молекулу, у якої певний баланс впливу структурних чинників забезпечує більші значення показників антикарієсної активності, ніж у молекул навчальної вибірки.
Ключові слова: антикарієсні агенти, карієс-профілактична ефективність, мінералізуючий індекс, SiRMS – симплексне представлення молекулярної структури, QSАR.
REFERENCES
- Whelton HP, Spencer AJ, Do LG, Rugg-Gunn AJ. Fluoride revolution and dental caries: evolution of policies for global use. J Dent Res. 2019;98(8):837–846. doi: 10.1177/0022034519843495.
- Zhou W, Chen H, Weir MD, et al. Novel bioactive dental restorations to inhibit secondary caries in enamel and dentin under oral biofilms. J Dent. 2023;133:104497. doi: 10.1016/j.jdent.2023.104497.
- Alhussein A, Alsahafi R, Balhaddad AA, et al. Novel bioactive nanocomposites containing calcium fluoride and calcium phosphate with antibacterial and low-shrinkage-stress capabilities to inhibit dental caries. Bioengineering. 2023;10(9):991. doi: 10.3390/bioengineering10090991.
- Mankar N, Kumbhare S, Nikhade P, Mahapatra J, Agrawal P. Role of fluoride in dentistry: A narrative review. Cureus. 2023;15(12):e50884. doi: 10.7759/cureus.50884.
- Yeh C-H, Wang Y-L, Vo TTT, Lee Y-C, Lee I-T. Fluoride in dental caries prevention and treatment: Mechanisms, clinical evidence, and public health perspectives. Healthcare. 2025;13(17):2246. doi: 10.3390/healthcare13172246.
- Baik A, Alamoudi N, El-Housseiny A, Altuwirqi A. Fluoride varnishes for preventing occlusal dental caries: A review. Dent J. 2021;9(6):64. doi: 10.3390/dj9060064.
- Kakkar M, Kapoor V, Singla SK, Jethi RK. Fluoride and biological mineralization II: Mechanism of action of fluoride to influence the collagen-induced in vitro mineralization and demineralization reactions. Biol Trace Elem Res. 2021;199:4145–4153. doi: 10.1007/s12011-020-02544-7.
- Cui T, Luo W, Xu L, Yang B, Zhao W, Cang H. Progress of antimicrobial discovery against the major cariogenic pathogen Streptococcus mutans. Curr Issues Mol Biol. 2019;32:601–644. doi: 10.21775/cimb.032.601.
- Burduṣel A-C, Gherasim O, Grumezescu AM, Mogoantӑ L, Ficai A, Andronescu E. Biomedical application of silver nanoparticles: an up-to-date overview. Nanomaterials. 2018;8(9):681. doi: 10.3390/nano8090681.
- Hosny S, Gaber GA, Ragab MS, Ragheb MA, Anter M, Mohamed LZ. A comprehensive review of silver nanoparticles (AgNPs): Synthesis strategies, toxicity concerns, biomedical applications, AI-driven advancements, challenges, and future perspectives. Arab J Sci Eng. 2025. doi: 10.1007/s13369-025-10612-0.
- Duffin S, Duffin M, Grootweld M. Revisiting fluoride in the twenty-first century: safety and efficacy considerations. Front Oral Health. 2022; 3: 873157. doi: 10.3389/froh.2022.873157.
- Gelmboldt VO, Kravtsov VCh, Fonari MS. Ammonium hexafluoridosilicates: Synthesis, structures, properties, applications. J Fluorine Chem. 2019;221(5):91–102. doi: 10.1016/j.jfluchem.2019.04.005.
- Politz AR, Scott L, Montz H. Ammonium hexafluorosilicate: A prospective alternative to silver diamine fluoride. Undergraduate Research Scholars Program. 2020. Available from: https://hdl.handle.net/1969.1/189278.
- Prodan OV. Syntez, fizyko-khimichni vlastyvosti ta biolohichna aktyvnist «oniievykh» heksafluorosylikativ [Synthesis, physico-chemical properties and biological activity of “onium” hexafluorosilicates]: Abstract of the dissertation for the degree of Candidate of Pharmaceutical Science: 15.00.02 – Pharmaceutical Сhemistry and Pharmacognosy. Lviv, 2017. 20 p. (in Ukrainian).
- Levitsky AP, Makarenko OA, Khodakov IV, Zelenina YuV. Fermentatyvnyi metod otsinky stanu kistkovoi tkanyny [Enzymatic method of the estimation of bone tissue state]. Odesa Med J. 2006;3:17–21 (in Ukrainian).
- Gelmboldt VO, Khromagina LM, Nikitin OV, Fizor NS. Biological activity of 3-hydroxymethylpyridinium hexafluorosilicate monohydrate and 4-hydroxymethylpyridinium hexafluorosilicate as candidates for anticaries agents. Odesa Med J. 2024;2:75–80. doi: 10.32782/2226-2008-2024-2-13.
- Kuz’min V, Artemenko A, Ognichenko L, et al. Simplex representation of molecular structure as universal QSAR/QSPR tool. Struct Chem. 2021;32(4):1365–1392. doi: 10.1007/s11224-021-01793-z.
- Gelmboldt V, Ognichenko L, Shyshkin I, Kuz’min V. QSPR models for water solubility of ammonium hexafluorosilicates: analysis of the effects of hydrogen bonds. Struct Chem. 2021;32(1):309–319. doi: 10.1007/s11224-020-01652-3.
- Rännar S, Lindgren F, Geladi P, Wold S. A PLS kernel algorithm for data sets with many variables and fewer objects. Part 1: Theory and algorithm. J Chemometrics. 1994;8:111–125. doi: 10.1002/cem.1180080204.
- Carhart RE, Smith DH, Venkataraghavan R. Atom pairs as molecular features in structure – activity studies. Definition and application. J Chem Inf Comput Sci. 1985;25:64–73. doi: 10.1021/ci00046a002.
