Інформативність генотипування збудника туберкульозу

Abstract

Метою даного дослідження було отримати генетичні профілі мікобактерій за допомогою визначення шести локусів VNTR (MIRU10, MIRU26, MIRU31, MIRU39, MIRU40, ETR A) та вивчити особливості генотипу медикаментозно-резистентних штамів мікобактерій у хворих на туберкульоз.

The aim of present study was to obtain genetic profiles of Mycobacterium through detection of six VNTR-loci and determine the peculiarity of the genotype of drug-resistant strains. Loci MIRU10, MIRU26, MIRU40 і ETR A have exhibited high polymorphism in group non-Beijing, while loci MIRU26 and MIRU31 — in Beijing family. Among Beijing family isolates there were such clusters as 355335, 355344, 355345, 356335, 356344, 375334, 375344, 385345, 385334. Clusters 355335, 375334 and 385334 have had high level of multi-resistance and mutations in katG and rpoB genes. The most spreading cluster among non-Beijing isolates was 452242, that have had high level of multi-resistance and mutations in katG and rpoB genes.

Целью исследования было получить генетические профили микобактерий путем определения шести локусов VNTR (MIRU10, MIRU26, MIRU31, MIRU39, MIRU40, ETR A) и определить особенности генотипа медикаментозно-резистентных штаммов микобактерий у больных туберкулезом. Локусы MIRU10, MIRU26, MIRU40 и ETR A выявили высокий полиморфизм в группе non-Beijing, локусы MIRU26 и MIRU31 — в семействе Beijing. Среди изолятов семейства Beijing преобладали такие кластеры, как 355335, 355344, 355345, 356335, 356344, 375334, 375344, 385345, 385334. Кластеры 355335, 375334 и 385334 имели высокий уровень мультирезистентности и мутаций в генах katG и rpoB. Среди изолятов из группы non-Beijing самым распространенным кластером был 452242, который характеризовался высоким уровнем мультирезистентности и высокой частотой одновременных мутаций в генах katG и rpoB.